ค่าธรรมเนียมวีซ่าสำหรับคนไทย ซึ่งได้ประกาศใช้เมื่อ วันที่ 1 เมษายน 2008 มีรายละเอียดดังต่อไปนี้
วีซ่า ทั่วไป
900 บาท
วีซ่า Multiple
1,800 บาท (สำหรับการเดินทางหลายครั้ง)
วีซ่าทรานซิท
220 บาท (สำหรับการเดินทางผ่าน)
ที่ มา : สถานเอกอัครราชทูตญี่ปุ่นประจำประเทศไทย
